攻占了日本东京，并不意味着日本本土的战火就结束了，整个日本三岛的由日本人组成的抵抗部队，简直是多如牛毛，为此中华帝国皇家陆军在日本本土一直驻扎了大量军队，清剿各地这些日本人组成的抵抗部队，而日本的本州岛、九州岛和四国岛，则成为了中华帝国的3个行省。
由日本人组成的抵抗部队非常顽强，而且得到了所有日本人的支持，中华帝国皇家陆军从1915年开始，一直清剿了2年的时间，也没有彻底消灭剿灭日本人的抵抗部队。
到了1917年，按照中华帝国皇帝林大鑫的命令，所有日本人被强行迁离了原日本的三岛，被迁移到了非洲刚果地区，这个时候整个日本只剩下大约2500万人，但是最后能抵达非洲的日本人，仅仅不足600万，近2000万日本人无缘无故的失踪了，至于怎么失踪的，成为了中华帝国的最高机密。
把所有日本人迁走，就等于断了日本各地抵抗部队的根基，最终一支支日本抵抗部队被剿灭。
1919年4月1日，日本最后一支抵抗部队在原日本九州岛的山区被围歼，这支抵抗部队的指挥官，十八岁的本田真司在弹尽粮绝的情况下，带领残余的十几名日本人，一起刨腹自杀。
在原日本三岛的日本抵抗部队彻底剿灭之后，中华帝国开始向这3个行省大量移民，日本这个国家彻底消失。
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